Deze vorm van behandelen is recent ontwikkeld. De EMDR behandeling is net zoals de CGT gericht op het verminderen van angst en de herinnering van het trauma.
Bij EMDR wordt de gevoeligheid voor een bepaalde omgevingsfactor gecombineerd met een afleiding. Bijvoorbeeld dat de patiënt met de ogen handbewegingen van de therapeut moet volgen. Of dat de patiënt moet luisteren naar piepjes die afwisselend door een koptelefoon in het linker- en het rechteroor worden afgespeeld.

Hoe gaat dit te werk?
De patiënt moet aan de gebeurtenis terug denken met de gevoelens en beelden die daarbij horen. De therapeut zal op dat moment zorgen dat er een afleidende factor is.
Na een set wordt er een pauze genomen, zodat de patiënt tot rust kan komen. De therapeut zal tussendoor vragen hoe de patiënt zich voelt en wat er op dat moment speelt in zijn/haar gedachten.

Als de patiënt een tijd bezig is met de behandeling zal langzamerhand de herinnering verzachten en minder sterk worden. De emoties zullen minder snel opkomen en het wordt dus gemakkelijker om aan de gebeurtenis terug te denken.
In sommige gevallen zullen de beelden vervagen en kleiner worden.

EMDR blijkt in buitenlandse studies even effectief te zijn in de behandeling van PTSS als CGT. Een belangrijke overeenkomst tussen beide protocollen is het gebruik van exposure (afleiding).